学院教学科研设施完善。现有5000多平方米的教学、科研和办公用房，教学及科研仪器1800余万元，拥有江苏省海洋药物活性分子筛选重点实验室、江苏省海洋生物医药与生物制品工程研究中心、江苏省海洋药物和现代中药创制重点实验室（与康缘药业共建）和江苏省海洋药用资源开发工程中心。与恒瑞医药、原创药物联合共建江苏省抗肿瘤及心血管类原料药产业创新中心，与豪森药业和杰瑞药业分别建立高价值专利培育示范中心，与原创药物、贵科药业、杰瑞药业、宇田医药、神曲医药、连云港中医院建立了6家企业研究生工作站，其中，杰瑞药业、贵科药业和原创药物获评省优秀研究生工作站。

学院科研成果突出。近年来获得国家级科研项目14项，各类纵横向科研项目累计227项，到账经费达6248万元，其中，联合企业开展科技攻关，签订重大科技横向（>500万元/项）课题2项，实现重大科技成果转化1项（260万元）。师生累计发表高水平科研论文349篇，其中SCI论文237篇，授权专利65项，获省部级科技进步奖6项，首次实现江苏省科技进步奖一等奖突破（学校首个）。

学院紧盯药学及相关交叉学科发展趋势，促进化学和生物制药融合发展，彰显海洋药物特色，适时发展中药学，为医药产业创新发展提供高素质复合型应用人才和高水平科技服务。